Evangelická církev, a stejně tak i sbor v Nymburce, se spravuje podle zásad presbyterně-synodních. V čele sboru stojí volený kolektivní orgán - staršovstvo. Sbor jako celek pak vybírá a volí svého faráře/farářku, který/která je členem staršovstva.
V září 2020 byli na šestileté období presbytery sboru zvoleni tito bratři a sestry:
Pavel Hamták (kurátor), Tomáš Groll (místokurátor), Jitka Češková, Alžběta Hájková, Jana Janů Jeřábková, Jana Kinclová, Irena Opočenská, Marie Řezníčková, Ester Šárovcová, Jindřich Šťastný, Martina Votavová
Náhradníci: Jiří Hofman, Jan Obermann, Regina Váchová