Evangelická církev, a stejně tak i sbor v Nymburce, se spravuje podle zásad presbyterně-synodních. V čele sboru stojí volený kolektivní orgán - staršovstvo. Sbor jako celek pak vybírá a volí svého faráře/farářku, který/která je členem staršovstva.
V září 2020 byli na šestileté období presbytery sboru zvoleni tito bratři a sestry:
Jana Kinclová (kurátorka od 1. 8. 2025), Pavel Hamták (kurátor do 31. 7. 2025), Tomáš Groll (místokurátor), Jitka Češková, Alžběta Hájková, Jana Janů Jeřábková, Irena Opočenská, Marie Řezníčková, Ester Šárovcová, Jindřich Šťastný, Martina Votavová
Náhradníci: Jiří Hofman, Jan Obermann, Regina Váchová